В Генпрокуратуру, МОН, а так же в Администрацию Президента поступило коллективное письмо с жалобой на руководителя Жанболата Мелдешева. В обращении на пяти листах бывшие и действующие сотрудники центра, некоторые из которых являются выпускниками программы «Болашак», заявляют, что их руководитель вынуждает увольняться «неугодных сотрудников, чтобы освободить места для своих людей. Также в обращении озвучен целый ряд нарушений со стороны руководства центра.
Министр образования Ерлан Сагадиев решил лично разобраться в инциденте: «У нас внутренние расследования проходили неоднократно, таких фактов не выявлено. Если кто-то пишет, нужно писать на мое имя заявление, и тогда мы будем проводить служебное расследование по этому поводу. Но раз через СМИ обратились, мы тогда проведем проверку и доложим».
Известно, что под обращением подписались 25 человек. Также обнародована видеозапись совещания, на которой предположительно кто-то из руководителей оскорбительно высказывается о стипендиатах программы «Болашак».